Con premiere no recuerdo muy bien como, ya que hace años que me tire para linux y ahora lo hago con cinelerra, pero el sistema es el mismo.
En cinelerra, por ejemplo, si quieres hacer un efecto "lupa"(utilizar un trozo de la imagen ampliada en un recuadro independiente)
debes duplicar el video, y en uno de ellos (el que queda encima)jugar con el proyector y la cámara para ubicar el trozo de video y su zoom y colocar esa porción en el lugar de la pantalla que prefieras.
Si ademas quieres que se vea en tiempo real como se va realizando el proceso del zoom y los movimientos tienes que utilizar loa keyframes o fotogramas clave.
No se si me he explicado o te he liado mas.
Supongo que ya habras pasado por aqui, pero en este link esplican alguyna cosa sobre el tema con premiere.
http://help.adobe.com/es_ES/premiereelements/using/WSC360ECBD-97C2-4953-AD24-4DDB564930A2.html